为了尽量减低疫情在社区扩散的风险，香港特区政府1月28日宣布以下跨境交通特别安排。

跨境铁路

由1月30日起，全面暂停高铁香港段及城际直通车所有班次，高铁西九龙站亦会暂时关闭作彻底清洁，直至另行公布。已购票的乘客请保留车票或收据，可获全数退款。香港铁路有限公司（港铁公司）会尽快公布退款安排。

东铁线罗湖及落马洲支线出入境方面，特区政府理解有部分市民有一定的出行需要，故暂时不拟暂停服务。

跨境陆路交通

因应沙头角及文锦渡管制站暂停开放旅客检查及跨境私家车通道，使用该两个口岸的跨境巴士同时暂停服务，跨境私家车及出租车亦不能使用有关口岸。

使用其他道路口岸（即落马洲管制站、深圳湾口岸及港珠澳大桥香港口岸）的跨境巴士及穿梭巴士服务（包括皇岗口岸短途跨境巴士、皇巴及金巴），由1月30日起减少班次，乘客请留意特区政府公布最新的跨境交通消息及向有关营办商查询服务详情。

航空运输

由1月30日起，四间香港航空公司：国泰航空、香港航空、国泰港龙航空及香港快运航空将逐步减少来往香港及内地合共24个航点的定期客运航班，由每星期合共约480班减至约240班香港跨境巴士文锦渡，直至另行通告。

各航空公司会在其网页公布相关详细安排，并协助受影响的乘客安排重新订位、退票及更改行程。另外，香港来往湖北省的所有航班已于1月24日暂时停止。

特区政府亦已联络内地有关单位及相关航空公司，安排逐步缩减约一半来往香港及内地各航点的客运航班。相关航空公司会公布有关安排详情。

跨境渡轮

香港特区政府海事处辖下的尖沙咀中国客运码头及屯门客运码将于1月30日停止跨境渡轮服务，直至另行通告。

上环港澳码头的跨境渡轮服务会因应实际情况而作出调整。有关航班详情香港跨境巴士文锦渡， 请留意相关渡轮公司的公布。